سید مجتبی حسینی در شهریور ۱۴۰۳ با حکم ریاست سازمان زندان‌ها اقدامات تامینی و تربیتی کشور به سمت مدیر کل زندان‌های استان زنجان منصوب گردید. وی پیش از این در سمت مدیرکل زندان‌های استان های اردبیل ، کرمان و خراسان رضوی مشغول به خدمت بوده و مسئولیت ندامتگاه کرج را عهده دار بوده است .