سید مجتبی حسینی در شهریورماه ۱۴۰۳ با حکم ریاست سازمان زندان‌ها و اقدامات تأمینی و تربیتی کشور به سمت مدیرکل زندان‌های استان زنجان منصوب گردید. وی پیش از این، مسئولیت مدیرکلی زندان‌های استان‌های اردبیل، کرمان و خراسان رضوی را بر عهده داشته و همچنین سابقه مدیریت ندامتگاه کرج را در کارنامه خدمتی خود دارد. ایشان دارای مدرک کارشناسی ارشد تاریخ ایران اسلامی بوده و از مدیران با تجربه و خوش‌سابقه در حوزه اصلاح و تربیت کشور به شمار می‌رود.